Les ministères se succèdent, mais la République poursuit sa lutte implacable contre l’Église. Quel que soit le sujet de la discussion, Mgr Freppel défend la Patrie et la Religion avec une science et une sagesse magistrales. Ses ennemis eux-mêmes le reconnaissent : « Il n’y a absolument rien à répliquer à l’argumentation si puissante de l’évêque. » Mais il ne se limite pas à la lutte contre la république laïque. Dans son mandement du carême 1882, l’évêque d’Angers attaque le mal à sa source, « l’athéisme, cette plante parasite et malsaine, née de la corruption des mœurs » et tourne ses diocésains vers le Ciel.